Thread by @C_A_Gustave, 1/20Question "chaud-patate" du moment : P.1 est-il plus transmissible que B.1.1.7 [...]

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Question "chaud-patate" du moment : P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien"> est-il plus transmissible que B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches"> ?
Petit thread de réflexion/discussion sur le sujet, donc ouvert+++ aux apports/contradictions/échanges...

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Les comparaisons internationales sont sujettes aux biais :

A) les échanges locaux entres territoires peuvent fortement influencer la diffusion de tel ou tel variant selon la proximité et interactions entre le territoire d& #39;étude et un foyer épidémique du variant...

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Ceci pourrait expliquer l& #39;apparente opposition entre la relation P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien">/B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches"> en métropole et en Guyane :

Métropoles =
*échanges+++ continus avec

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches">
*moindres et ponctuels avec

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien">

>apport massif et continu de B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches">
>apport sporadique de P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien">...

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Ceci peut suffire à "driver" une

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="↗️" title="Nordost gerichteter Pfeil" aria-label="Emoji: Nordost gerichteter Pfeil"> rapide de B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches"> face à P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien"> même si transmissibilité B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches"> < transmissibilité P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien">

A l& #39;inverse, en Guyane =
*échanges+++ et continus avec

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien">
*ponctuels avec

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇪🇺" title="Flagge der Europäischen Union" aria-label="Emoji: Flagge der Europäischen Union">/

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches">

>apport massif et continu de P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien">
>sporadique pour B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches">

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Ceci pourrait expliquer qu& #39;en métropole B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches"> caracole à 80-90% des cas dépistés, face à P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien"> qui peine à >1% sur moyenne nationale...

5/20Ceci pourrait expliquer qu& #39;en métropole B.1.1.7https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable=

caracole à 80-90% des cas dépistés, face à P.1https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien"> qui peine à >1% sur moyenne nationale..." title="5/20Ceci pourrait expliquer qu& #39;en métropole B.1.1.7https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches"> caracole à 80-90% des cas dépistés, face à P.1https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien"> qui peine à >1% sur moyenne nationale..." class="img-responsive" style="max-width:100%;"/>

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Alors qu& #39;en Guyane, après une période où B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches"> et P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien"> ont co-circulé à haut niveau, P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien"> a fini par écraser B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches">, peut-être au gré des importations fréquentes de P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien"> depuis le Brésil voisin :

6/20Alors qu& #39;en Guyane, après une période où B.1.1.7https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable=

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Autre biais :
B) La transmissibilité dépend des caractéristiques épidémiologiques locales et notamment de l& #39;immunité de population.

En effet, P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien"> (comme B.1.351

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇿🇦" title="Flagge von Südafrika" aria-label="Emoji: Flagge von Südafrika">...) est doué d& #39;échappement immunitaire, notamment via des mutations telles que E484K ou K417T...

8/n
Ces mutations permettent à P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien"> d& #39;échapper (partiellement) à la neutralisation par les anticorps induits par une infection antérieure par les souches "historiques", B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches">... ou la vaccination...

9/n
Ainsi, P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien">, B.1.351

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇿🇦" title="Flagge von Südafrika" aria-label="Emoji: Flagge von Südafrika">... peuvent circuler plus efficacement que les autres variants dans une population déjà immunisée.

Ceci pourrait expliquer les disparités locales en métropole et notamment l& #39;expansion significative de P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien">/B.1.351

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇿🇦" title="Flagge von Südafrika" aria-label="Emoji: Flagge von Südafrika"> dans GE ou plus récemment IDF...

9/nAinsi, P.1https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable=

, B.1.351https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇿🇦" title="Flagge von Südafrika" aria-label="Emoji: Flagge von Südafrika">... peuvent circuler plus efficacement que les autres variants dans une population déjà immunisée.Ceci pourrait expliquer les disparités locales en métropole et notamment l& #39;expansion significative de P.1https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien">/B.1.351https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇿🇦" title="Flagge von Südafrika" aria-label="Emoji: Flagge von Südafrika"> dans GE ou plus récemment IDF..." title="9/nAinsi, P.1https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien">, B.1.351https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇿🇦" title="Flagge von Südafrika" aria-label="Emoji: Flagge von Südafrika">... peuvent circuler plus efficacement que les autres variants dans une population déjà immunisée.Ceci pourrait expliquer les disparités locales en métropole et notamment l& #39;expansion significative de P.1https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien">/B.1.351https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇿🇦" title="Flagge von Südafrika" aria-label="Emoji: Flagge von Südafrika"> dans GE ou plus récemment IDF...">

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Cependant, on peut contourner (au moins partiellement) ces biais via les études comparant P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien"> ou B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches"> aux variants "historiques".

Ces études ont donc un référentiel commun ayant frappé une pop non-immunisée lors des 1ères vagues...

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Ainsi, ces études peuvent être vues ainsi :

P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien"> VERSUS A
B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches"> VERSUS B
où A et B ne sont pas strictement identiques mais correspondent aux diverses souches initiales de SARS-CoV-2, et une période où les populations étaient immunologiquement "naïves"...

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On peut donc tirer une comparaison indirecte à partir de ces études :

Si P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien"> = 2,6*A
Si B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches"> = 1,6*B
Et que A ~ B

Alors P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien"> = 1,6*B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches">
(ou P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien"> = 60% plus transmissible que B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches">)

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Le "2,6" et "1,6" ne sont pas choisis arbitrairement pour l& #39;exemple, mais tirés de publications :

Pour P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien"> (étude brésilienne)
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.03.03.21252706v3

Pour">https://www.medrxiv.org/content/1... B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches"> (avis du conseil scientifique)
https://hal-pasteur.archives-ouvertes.fr/pasteur-03149525/document">https://hal-pasteur.archives-ouvertes.fr/pasteur-0...

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On peut donc craindre que P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien"> finisse par l& #39;emporter sur B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches"> y compris en métropole.

MAIS, P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien"> n& #39;est pas le seul concurrent :
B.1.351

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇿🇦" title="Flagge von Südafrika" aria-label="Emoji: Flagge von Südafrika">
B.1.617/618

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇮🇳" title="Flagge von Indien" aria-label="Emoji: Flagge von Indien">
B.1.427/429

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇺🇸" title="Flagge der Vereinigten Staaten" aria-label="Emoji: Flagge der Vereinigten Staaten">
B.1.616

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇫🇷" title="Flagge von Frankreich" aria-label="Emoji: Flagge von Frankreich"> (breton)
19B/501Y A.27

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇫🇷" title="Flagge von Frankreich" aria-label="Emoji: Flagge von Frankreich"> ("Mondor")
...

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Le variant B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches">, désormais à 80-90% des infections dépistées, représente le nouveau référentiel. Il ne faut donc pas s& #39;attendre à une explosion unitaire d& #39;un variant (comme B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches"> depuis début 2021), mais à une course continue entre plusieurs compétiteurs...

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B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches"> + 20% d& #39;infectés depuis 03/2020 + 17% de vaccinés sont encore loin d& #39;avoir épuisé le réservoir d& #39;individus pouvant être contaminés (réservoir peut-être intarissable si la dérive antigénique des variants permet un échappement immunitaire suffisant pour réinfection)

17/20
Pour voir émerger un nouveau variant, il faut donc qu& #39;il "court" plus vite que B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches"> !
Et plutôt que l& #39;émergence d& #39;UN variant, nous aurons plutôt un cocktail de variants de +/+ transmissibles, et/ou de moins en moins neutralisables...

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Il ne faut donc peut-être pas s& #39;attendre à une expansion brutale d& #39;un variant mais plutôt à une évolution relative de la % des variants les uns face aux autres, dans un équilibre progressivement déplacé en faveur des plus efficaces à se transmettre...

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Pour prendre une illustration en lien avec l& #39;actualité, c& #39;est un peu comme la station ISS et la capsule Crew Dragon !
Elle avait l& #39;air d& #39;avancer de quelques cm/seconde en s& #39;approchant de l& #39;ISS, alors qu& #39;en fait elle filait à >28000 km/h !!! comme l& #39;ISS

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L& #39;ISS c& #39;est le B.1.1.7

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇬🇧" title="Flagge des Vereinigten Königreiches" aria-label="Emoji: Flagge des Vereinigten Königreiches"> qui file à 28000 km/h et sert désormais de référentiel face aux autres variants.
Et P.1

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="🇧🇷" title="Flagge von Brasilien" aria-label="Emoji: Flagge von Brasilien"> c& #39;est Crew Dragon qui file à 28000 km/h + 50% de 28000 (hypothèse déduite des comparaisons aux souches historiques).

On sait comment ça finit...

https://abs.twimg.com/emoji/v2/... draggable="false" alt="😅" title="Lächelndes Gesicht mit offenem Mund und Angstschweiß" aria-label="Emoji: Lächelndes Gesicht mit offenem Mund und Angstschweiß">

@threadreaderapp unroll please

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