1/20
Question "chaud-patate" du moment : P.1 est-il plus transmissible que B.1.1.7 ?
Petit thread de réflexion/discussion sur le sujet, donc ouvert+++ aux apports/contradictions/échanges...

2/20
Les comparaisons internationales sont sujettes aux biais :

A) les échanges locaux entres territoires peuvent fortement influencer la diffusion de tel ou tel variant selon la proximité et interactions entre le territoire d'étude et un foyer épidémique du variant...

3/20
Ceci pourrait expliquer l'apparente opposition entre la relation P.1/B.1.1.7 en métropole et en Guyane :

Métropoles =
*échanges+++ continus avec
*moindres et ponctuels avec

>apport massif et continu de B.1.1.7
>apport sporadique de P.1...

4/20
Ceci peut suffire à "driver" une rapide de B.1.1.7 face à P.1 même si transmissibilité B.1.1.7 < transmissibilité P.1

A l'inverse, en Guyane =
*échanges+++ et continus avec
*ponctuels avec /

>apport massif et continu de P.1
>sporadique pour B.1.1.7

5/20
Ceci pourrait expliquer qu'en métropole B.1.1.7 caracole à 80-90% des cas dépistés, face à P.1 qui peine à >1% sur moyenne nationale...

6/20
Alors qu'en Guyane, après une période où B.1.1.7 et P.1 ont co-circulé à haut niveau, P.1 a fini par écraser B.1.1.7, peut-être au gré des importations fréquentes de P.1 depuis le Brésil voisin :

7/20
Autre biais :
B) La transmissibilité dépend des caractéristiques épidémiologiques locales et notamment de l'immunité de population.

En effet, P.1 (comme B.1.351...) est doué d'échappement immunitaire, notamment via des mutations telles que E484K ou K417T...

8/n
Ces mutations permettent à P.1 d'échapper (partiellement) à la neutralisation par les anticorps induits par une infection antérieure par les souches "historiques", B.1.1.7... ou la vaccination...

9/n
Ainsi, P.1, B.1.351... peuvent circuler plus efficacement que les autres variants dans une population déjà immunisée.

Ceci pourrait expliquer les disparités locales en métropole et notamment l'expansion significative de P.1/B.1.351 dans GE ou plus récemment IDF...

10/20
Cependant, on peut contourner (au moins partiellement) ces biais via les études comparant P.1 ou B.1.1.7 aux variants "historiques".

Ces études ont donc un référentiel commun ayant frappé une pop non-immunisée lors des 1ères vagues...

11/20
Ainsi, ces études peuvent être vues ainsi :

P.1 VERSUS A
B.1.1.7 VERSUS B
où A et B ne sont pas strictement identiques mais correspondent aux diverses souches initiales de SARS-CoV-2, et une période où les populations étaient immunologiquement "naïves"...

12/20
On peut donc tirer une comparaison indirecte à partir de ces études :

Si P.1 = 2,6*A
Si B.1.1.7 = 1,6*B
Et que A ~ B

Alors P.1 = 1,6*B.1.1.7
(ou P.1 = 60% plus transmissible que B.1.1.7)

13/20
Le "2,6" et "1,6" ne sont pas choisis arbitrairement pour l'exemple, mais tirés de publications :

Pour P.1 (étude brésilienne)
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.03.03.21252706v3

Pour B.1.1.7 (avis du conseil scientifique)
https://hal-pasteur.archives-ouvertes.fr/pasteur-03149525/document

14/20
On peut donc craindre que P.1 finisse par l'emporter sur B.1.1.7 y compris en métropole.

MAIS, P.1 n'est pas le seul concurrent :
B.1.351
B.1.617/618
B.1.427/429
B.1.616 (breton)
19B/501Y A.27 ("Mondor")
...

15/20
Le variant B.1.1.7, désormais à 80-90% des infections dépistées, représente le nouveau référentiel. Il ne faut donc pas s'attendre à une explosion unitaire d'un variant (comme B.1.1.7 depuis début 2021), mais à une course continue entre plusieurs compétiteurs...

16/20
B.1.1.7 + 20% d'infectés depuis 03/2020 + 17% de vaccinés sont encore loin d'avoir épuisé le réservoir d'individus pouvant être contaminés (réservoir peut-être intarissable si la dérive antigénique des variants permet un échappement immunitaire suffisant pour réinfection)

17/20
Pour voir émerger un nouveau variant, il faut donc qu'il "court" plus vite que B.1.1.7 !
Et plutôt que l'émergence d'UN variant, nous aurons plutôt un cocktail de variants de +/+ transmissibles, et/ou de moins en moins neutralisables...

18/20
Il ne faut donc peut-être pas s'attendre à une expansion brutale d'un variant mais plutôt à une évolution relative de la % des variants les uns face aux autres, dans un équilibre progressivement déplacé en faveur des plus efficaces à se transmettre...

19/20
Pour prendre une illustration en lien avec l'actualité, c'est un peu comme la station ISS et la capsule Crew Dragon !
Elle avait l'air d'avancer de quelques cm/seconde en s'approchant de l'ISS, alors qu'en fait elle filait à >28000 km/h !!! comme l'ISS

20/20
L'ISS c'est le B.1.1.7 qui file à 28000 km/h et sert désormais de référentiel face aux autres variants.
Et P.1 c'est Crew Dragon qui file à 28000 km/h + 50% de 28000 (hypothèse déduite des comparaisons aux souches historiques).

On sait comment ça finit...

@threadreaderapp unroll please