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Donc l’équipe de l’IHU a sequencé plus de 300 génomes de SARS-CoV2. Donc j’ai regardé la publication d’un peu plus près pour voir si on pouvait y trouver des données soutenants les thèses de Didier Raoult: les deux variants du virus circulant en France. https://twitter.com/raoult_didier/status/1302911528102965252
Pour mémoire je rappelle que DR annonçait sur les ondes et dans les journaux qu’il y avait deux variants du virus en circulation en France: D614 et G614 et que ce dernier était moins virulent ce qui expliquait là moindre incidence de la maladie cet été ⬇️
Donc dans leur pré peint je me suis intéressé à l’arbre phylogénétique ci-dessous. Joli représentation dès différentes mutations et les variants d’origine. Mais la surprise. Des variant de Wihan donc D614, il n’y en a que deux, en violet en haut à gauche.
Donc je m’intéresse de plus près et on s’aperçoit qu’en fait il n’y a en tout et pour tout moins de 20 génomes qui ne sont pas des G614. On voit clairement au centre la branche G614 qui est le variant de ~90% des variants séquences à l’IHU. Alors ces deux souches DR??
Et oui comme on l'avait déjà démontré a l'époque le variant G614 est le variant ultra-majoritaire circulant en France depuis... Avril...
Mais alors pourquoi DR a-t-il raconté sur les onde cette fausse information non supportée par les données de l'IHU? https://twitter.com/EricBillyFR/status/1296800358778449920?s=20
Par ailleurs, dans cette publication il s annoncent avoir identifier 161 nouvelles mutations jamais trouvées auparavant. Cependant pour gonfler ce chiffres de mutations ils ont pris les génomes de référence de GISAID du ... 15 Avril!? Il y a presque 5 mois 🤷😳
Ainsi ces mutations qui en 5 mois auraient pu apparaître dans d’autres pays d’Europe, puisque c’est là que le variant G614 est très majoritaire, elles ne sont pas dans leur base de données de référence. Et donc la moitié des génomes contiennent des mutations nouvelles...
Enfin nouvelle pour l’IHU en date du 15 Avril... ça aurait été épieux de comparer avec les données GISAID les plus récentes.
bien dommage car la communauté scientifique aurait gagné à savoir au fur et à mesure si certains mutants émergeaient ou pas à différents endroits d’Europe
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